A Instituição tem como órgão máximo deliberativo o Conselho de Curadores e o órgão superior de gestão é a Diretoria Executiva.
A presidência da Diretoria Executiva e do Conselho de Curadores é exercida mediante nomeação, conforme determinação estatuária, pelo Revmo. Pe. Provincial da Província do Brasil Centro-Leste, da Companhia de Jesus, a partir de lista tríplice proposta pelo Conselho de Curadores.
O mandato da diretoria é para um período de 4 anos e os membros do Conselho de Curadores têm mandato vitalício.